Protein–RNA interactions for Protein: P05555

Itgam, Integrin alpha-M, mousemouse

Predictions only

Length 1,153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgamP05555 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ItgamP05555 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ItgamP05555 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ItgamP05555 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ItgamP05555 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ItgamP05555 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ItgamP05555 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ItgamP05555 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ItgamP05555 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ItgamP05555 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ItgamP05555 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ItgamP05555 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms