Protein–RNA interactions for Protein: P04224

H-2 class II histocompatibility antigen, E-K alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04224 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P04224 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P04224 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P04224 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P04224 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P04224 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P04224 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P04224 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P04224 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P04224 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P04224 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P04224 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P04224 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P04224 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P04224 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
P04224 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P04224 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P04224 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P04224 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P04224 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P04224 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P04224 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P04224 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
P04224 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P04224 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P04224 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P04224 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P04224 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P04224 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P04224 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04224 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04224 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04224 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04224 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04224 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04224 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04224 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04224 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P04224 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04224 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04224 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04224 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04224 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04224 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04224 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04224 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04224 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04224 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04224 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04224 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04224 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04224 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04224 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04224 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04224 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04224 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04224 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04224 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04224 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04224 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04224 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04224 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P04224 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P04224 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P04224 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P04224 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P04224 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P04224 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P04224 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P04224 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P04224 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P04224 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P04224 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P04224 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P04224 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P04224 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P04224 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P04224 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P04224 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P04224 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P04224 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P04224 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P04224 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P04224 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P04224 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P04224 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P04224 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P04224 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P04224 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P04224 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P04224 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P04224 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P04224 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P04224 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P04224 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P04224 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P04224 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P04224 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P04224 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P04224 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms