Protein–RNA interactions for Protein: P01803

Ig heavy chain V region AMPC1, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01803 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01803 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01803 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01803 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01803 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01803 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01803 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01803 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01803 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01803 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01803 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01803 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01803 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01803 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01803 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01803 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01803 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01803 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01803 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01803 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01803 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01803 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01803 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01803 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01803 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01803 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01803 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01803 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01803 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01803 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01803 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01803 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P01803 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P01803 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P01803 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01803 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01803 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01803 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01803 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01803 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01803 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01803 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01803 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01803 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01803 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01803 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01803 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01803 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01803 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01803 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01803 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01803 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01803 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01803 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01803 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01803 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01803 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01803 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01803 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01803 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01803 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01803 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01803 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01803 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01803 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01803 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01803 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01803 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01803 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01803 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01803 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01803 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01803 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01803 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01803 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01803 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01803 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01803 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01803 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01803 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01803 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01803 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01803 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01803 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01803 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01803 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01803 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01803 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01803 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01803 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01803 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01803 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01803 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01803 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01803 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01803 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01803 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01803 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01803 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01803 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms