Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl20O89093 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl20O89093 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl20O89093 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl20O89093 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl20O89093 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl20O89093 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl20O89093 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl20O89093 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl20O89093 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl20O89093 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl20O89093 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl20O89093 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl20O89093 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl20O89093 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl20O89093 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl20O89093 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl20O89093 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl20O89093 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl20O89093 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl20O89093 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl20O89093 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl20O89093 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl20O89093 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl20O89093 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl20O89093 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl20O89093 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl20O89093 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl20O89093 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl20O89093 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl20O89093 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl20O89093 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl20O89093 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl20O89093 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl20O89093 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl20O89093 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl20O89093 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl20O89093 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl20O89093 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl20O89093 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl20O89093 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl20O89093 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl20O89093 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl20O89093 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl20O89093 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl20O89093 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ccl20O89093 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ccl20O89093 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl20O89093 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl20O89093 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl20O89093 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl20O89093 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl20O89093 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl20O89093 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl20O89093 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl20O89093 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl20O89093 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl20O89093 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl20O89093 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl20O89093 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ccl20O89093 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ccl20O89093 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl20O89093 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl20O89093 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl20O89093 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl20O89093 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl20O89093 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl20O89093 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl20O89093 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl20O89093 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl20O89093 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl20O89093 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl20O89093 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl20O89093 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl20O89093 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl20O89093 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl20O89093 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl20O89093 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl20O89093 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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