Protein–RNA interactions for Protein: O89001

Cpd, Carboxypeptidase D, mousemouse

Predictions only

Length 1,377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CpdO89001 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CpdO89001 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CpdO89001 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CpdO89001 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CpdO89001 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
CpdO89001 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CpdO89001 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CpdO89001 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CpdO89001 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CpdO89001 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CpdO89001 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CpdO89001 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CpdO89001 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CpdO89001 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CpdO89001 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CpdO89001 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CpdO89001 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CpdO89001 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CpdO89001 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CpdO89001 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CpdO89001 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CpdO89001 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CpdO89001 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CpdO89001 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CpdO89001 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CpdO89001 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CpdO89001 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CpdO89001 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CpdO89001 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CpdO89001 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CpdO89001 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CpdO89001 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CpdO89001 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CpdO89001 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CpdO89001 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CpdO89001 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CpdO89001 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CpdO89001 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CpdO89001 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CpdO89001 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CpdO89001 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CpdO89001 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CpdO89001 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CpdO89001 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CpdO89001 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CpdO89001 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CpdO89001 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CpdO89001 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CpdO89001 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CpdO89001 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CpdO89001 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CpdO89001 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CpdO89001 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CpdO89001 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CpdO89001 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CpdO89001 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CpdO89001 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CpdO89001 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CpdO89001 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CpdO89001 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CpdO89001 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CpdO89001 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CpdO89001 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CpdO89001 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CpdO89001 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CpdO89001 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CpdO89001 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CpdO89001 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CpdO89001 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CpdO89001 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CpdO89001 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CpdO89001 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CpdO89001 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CpdO89001 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CpdO89001 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CpdO89001 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CpdO89001 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CpdO89001 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CpdO89001 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CpdO89001 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CpdO89001 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CpdO89001 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CpdO89001 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CpdO89001 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CpdO89001 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CpdO89001 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CpdO89001 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CpdO89001 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CpdO89001 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CpdO89001 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CpdO89001 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CpdO89001 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CpdO89001 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CpdO89001 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CpdO89001 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CpdO89001 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CpdO89001 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CpdO89001 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CpdO89001 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CpdO89001 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms