Protein–RNA interactions for Protein: O88892

Serf1, Small EDRK-rich factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 62 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serf1O88892 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Serf1O88892 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Serf1O88892 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Serf1O88892 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Serf1O88892 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Serf1O88892 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Serf1O88892 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Serf1O88892 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Serf1O88892 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Serf1O88892 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Serf1O88892 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Serf1O88892 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Serf1O88892 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Serf1O88892 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Serf1O88892 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Serf1O88892 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Serf1O88892 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Serf1O88892 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Serf1O88892 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Serf1O88892 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Serf1O88892 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Serf1O88892 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Serf1O88892 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Serf1O88892 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Serf1O88892 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Serf1O88892 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Serf1O88892 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Serf1O88892 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Serf1O88892 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Serf1O88892 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Serf1O88892 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Serf1O88892 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Serf1O88892 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Serf1O88892 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Serf1O88892 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Serf1O88892 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Serf1O88892 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Serf1O88892 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Serf1O88892 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Serf1O88892 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Serf1O88892 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Serf1O88892 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Serf1O88892 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Serf1O88892 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Serf1O88892 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Serf1O88892 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Serf1O88892 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Serf1O88892 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Serf1O88892 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Serf1O88892 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Serf1O88892 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Serf1O88892 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Serf1O88892 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Serf1O88892 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Serf1O88892 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Serf1O88892 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Serf1O88892 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Serf1O88892 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Serf1O88892 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Serf1O88892 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Serf1O88892 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Serf1O88892 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Serf1O88892 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Serf1O88892 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Serf1O88892 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Serf1O88892 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Serf1O88892 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Serf1O88892 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Serf1O88892 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Serf1O88892 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Serf1O88892 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Serf1O88892 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Serf1O88892 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Serf1O88892 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Serf1O88892 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Serf1O88892 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Serf1O88892 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Serf1O88892 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Serf1O88892 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Serf1O88892 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Serf1O88892 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Serf1O88892 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Serf1O88892 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Serf1O88892 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Serf1O88892 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Serf1O88892 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Serf1O88892 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Serf1O88892 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Serf1O88892 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Serf1O88892 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Serf1O88892 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Serf1O88892 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Serf1O88892 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Serf1O88892 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Serf1O88892 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Serf1O88892 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Serf1O88892 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Serf1O88892 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Serf1O88892 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Serf1O88892 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms