Protein–RNA interactions for Protein: O88824

Jtb, Protein JTB, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JtbO88824 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
JtbO88824 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
JtbO88824 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
JtbO88824 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
JtbO88824 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
JtbO88824 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
JtbO88824 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
JtbO88824 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
JtbO88824 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
JtbO88824 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
JtbO88824 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
JtbO88824 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
JtbO88824 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
JtbO88824 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
JtbO88824 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
JtbO88824 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
JtbO88824 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
JtbO88824 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
JtbO88824 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
JtbO88824 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
JtbO88824 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
JtbO88824 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
JtbO88824 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
JtbO88824 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
JtbO88824 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
JtbO88824 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
JtbO88824 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
JtbO88824 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
JtbO88824 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
JtbO88824 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
JtbO88824 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
JtbO88824 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
JtbO88824 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
JtbO88824 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
JtbO88824 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
JtbO88824 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
JtbO88824 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
JtbO88824 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
JtbO88824 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
JtbO88824 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
JtbO88824 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
JtbO88824 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
JtbO88824 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
JtbO88824 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
JtbO88824 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
JtbO88824 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
JtbO88824 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
JtbO88824 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
JtbO88824 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
JtbO88824 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
JtbO88824 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
JtbO88824 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
JtbO88824 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
JtbO88824 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
JtbO88824 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
JtbO88824 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
JtbO88824 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
JtbO88824 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
JtbO88824 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
JtbO88824 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
JtbO88824 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
JtbO88824 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
JtbO88824 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
JtbO88824 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
JtbO88824 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
JtbO88824 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
JtbO88824 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
JtbO88824 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
JtbO88824 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
JtbO88824 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
JtbO88824 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
JtbO88824 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
JtbO88824 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
JtbO88824 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
JtbO88824 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
JtbO88824 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
JtbO88824 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
JtbO88824 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
JtbO88824 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
JtbO88824 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
JtbO88824 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
JtbO88824 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
JtbO88824 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
JtbO88824 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
JtbO88824 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
JtbO88824 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
JtbO88824 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
JtbO88824 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
JtbO88824 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
JtbO88824 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
JtbO88824 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
JtbO88824 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
JtbO88824 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
JtbO88824 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
JtbO88824 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
JtbO88824 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
JtbO88824 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
JtbO88824 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
JtbO88824 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
JtbO88824 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms