Protein–RNA interactions for Protein: O88425

Nme6, Nucleoside diphosphate kinase 6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme6O88425 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nme6O88425 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Nme6O88425 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nme6O88425 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme6O88425 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nme6O88425 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms