Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Itgb5O70309 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itgb5O70309 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itgb5O70309 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itgb5O70309 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itgb5O70309 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itgb5O70309 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itgb5O70309 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itgb5O70309 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Itgb5O70309 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Itgb5O70309 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Itgb5O70309 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Itgb5O70309 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Itgb5O70309 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Itgb5O70309 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Itgb5O70309 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Itgb5O70309 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Itgb5O70309 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Itgb5O70309 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Itgb5O70309 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Itgb5O70309 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Itgb5O70309 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Itgb5O70309 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itgb5O70309 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itgb5O70309 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itgb5O70309 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itgb5O70309 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itgb5O70309 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itgb5O70309 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itgb5O70309 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itgb5O70309 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itgb5O70309 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itgb5O70309 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itgb5O70309 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itgb5O70309 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itgb5O70309 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Itgb5O70309 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itgb5O70309 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itgb5O70309 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itgb5O70309 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itgb5O70309 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itgb5O70309 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itgb5O70309 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itgb5O70309 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itgb5O70309 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Itgb5O70309 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itgb5O70309 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itgb5O70309 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itgb5O70309 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itgb5O70309 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itgb5O70309 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itgb5O70309 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itgb5O70309 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Itgb5O70309 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itgb5O70309 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itgb5O70309 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itgb5O70309 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itgb5O70309 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itgb5O70309 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itgb5O70309 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itgb5O70309 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Itgb5O70309 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itgb5O70309 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itgb5O70309 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itgb5O70309 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itgb5O70309 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itgb5O70309 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itgb5O70309 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itgb5O70309 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itgb5O70309 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itgb5O70309 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itgb5O70309 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itgb5O70309 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itgb5O70309 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itgb5O70309 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itgb5O70309 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Itgb5O70309 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Itgb5O70309 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Itgb5O70309 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Itgb5O70309 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Itgb5O70309 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Itgb5O70309 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Itgb5O70309 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Itgb5O70309 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Itgb5O70309 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Itgb5O70309 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Itgb5O70309 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Itgb5O70309 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Itgb5O70309 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Itgb5O70309 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Itgb5O70309 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Itgb5O70309 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Itgb5O70309 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Itgb5O70309 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Itgb5O70309 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Itgb5O70309 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Itgb5O70309 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Itgb5O70309 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Itgb5O70309 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Itgb5O70309 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms