Protein–RNA interactions for Protein: O55234

Psmb5, Proteasome subunit beta type-5, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb5O55234 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psmb5O55234 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psmb5O55234 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psmb5O55234 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psmb5O55234 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psmb5O55234 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psmb5O55234 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psmb5O55234 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psmb5O55234 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psmb5O55234 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psmb5O55234 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psmb5O55234 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psmb5O55234 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psmb5O55234 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psmb5O55234 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psmb5O55234 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psmb5O55234 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Psmb5O55234 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psmb5O55234 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psmb5O55234 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psmb5O55234 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psmb5O55234 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psmb5O55234 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psmb5O55234 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psmb5O55234 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Psmb5O55234 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psmb5O55234 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psmb5O55234 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psmb5O55234 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psmb5O55234 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psmb5O55234 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psmb5O55234 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psmb5O55234 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psmb5O55234 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psmb5O55234 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Psmb5O55234 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psmb5O55234 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psmb5O55234 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psmb5O55234 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psmb5O55234 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psmb5O55234 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmb5O55234 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmb5O55234 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmb5O55234 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmb5O55234 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmb5O55234 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmb5O55234 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmb5O55234 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmb5O55234 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmb5O55234 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmb5O55234 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmb5O55234 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmb5O55234 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmb5O55234 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmb5O55234 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmb5O55234 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psmb5O55234 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psmb5O55234 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psmb5O55234 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psmb5O55234 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psmb5O55234 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psmb5O55234 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psmb5O55234 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psmb5O55234 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Psmb5O55234 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psmb5O55234 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psmb5O55234 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psmb5O55234 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psmb5O55234 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Psmb5O55234 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Psmb5O55234 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Psmb5O55234 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Psmb5O55234 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Psmb5O55234 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Psmb5O55234 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Psmb5O55234 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psmb5O55234 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psmb5O55234 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psmb5O55234 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psmb5O55234 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psmb5O55234 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psmb5O55234 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psmb5O55234 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psmb5O55234 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psmb5O55234 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psmb5O55234 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psmb5O55234 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psmb5O55234 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psmb5O55234 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psmb5O55234 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psmb5O55234 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psmb5O55234 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psmb5O55234 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psmb5O55234 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Psmb5O55234 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psmb5O55234 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psmb5O55234 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psmb5O55234 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psmb5O55234 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psmb5O55234 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms