Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dsg2O55111 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dsg2O55111 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dsg2O55111 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dsg2O55111 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dsg2O55111 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dsg2O55111 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dsg2O55111 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dsg2O55111 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dsg2O55111 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dsg2O55111 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dsg2O55111 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dsg2O55111 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dsg2O55111 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dsg2O55111 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dsg2O55111 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dsg2O55111 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dsg2O55111 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Dsg2O55111 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dsg2O55111 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dsg2O55111 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dsg2O55111 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dsg2O55111 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dsg2O55111 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dsg2O55111 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dsg2O55111 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dsg2O55111 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dsg2O55111 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dsg2O55111 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dsg2O55111 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dsg2O55111 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dsg2O55111 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dsg2O55111 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Dsg2O55111 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dsg2O55111 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dsg2O55111 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dsg2O55111 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dsg2O55111 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dsg2O55111 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dsg2O55111 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dsg2O55111 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dsg2O55111 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dsg2O55111 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms