Protein–RNA interactions for Protein: O55038

Cxcl13, C-X-C motif chemokine 13, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl13O55038 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcl13O55038 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcl13O55038 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcl13O55038 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Cxcl13O55038 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcl13O55038 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcl13O55038 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcl13O55038 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcl13O55038 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcl13O55038 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcl13O55038 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcl13O55038 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcl13O55038 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcl13O55038 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcl13O55038 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcl13O55038 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcl13O55038 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcl13O55038 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Cxcl13O55038 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Cxcl13O55038 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Cxcl13O55038 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Cxcl13O55038 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcl13O55038 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Cxcl13O55038 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcl13O55038 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcl13O55038 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcl13O55038 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcl13O55038 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcl13O55038 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcl13O55038 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcl13O55038 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcl13O55038 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcl13O55038 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Cxcl13O55038 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Cxcl13O55038 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl13O55038 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Cxcl13O55038 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl13O55038 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl13O55038 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcl13O55038 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcl13O55038 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcl13O55038 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcl13O55038 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcl13O55038 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcl13O55038 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcl13O55038 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcl13O55038 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcl13O55038 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcl13O55038 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcl13O55038 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcl13O55038 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcl13O55038 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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