Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SlkO54988 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SlkO54988 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SlkO54988 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SlkO54988 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SlkO54988 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SlkO54988 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SlkO54988 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SlkO54988 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SlkO54988 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SlkO54988 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SlkO54988 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SlkO54988 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SlkO54988 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SlkO54988 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SlkO54988 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SlkO54988 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SlkO54988 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SlkO54988 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SlkO54988 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SlkO54988 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SlkO54988 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SlkO54988 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SlkO54988 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SlkO54988 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SlkO54988 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SlkO54988 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SlkO54988 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SlkO54988 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SlkO54988 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SlkO54988 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SlkO54988 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SlkO54988 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SlkO54988 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SlkO54988 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SlkO54988 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SlkO54988 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SlkO54988 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SlkO54988 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SlkO54988 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SlkO54988 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SlkO54988 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SlkO54988 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SlkO54988 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SlkO54988 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SlkO54988 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SlkO54988 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SlkO54988 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SlkO54988 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SlkO54988 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SlkO54988 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SlkO54988 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SlkO54988 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SlkO54988 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SlkO54988 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SlkO54988 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SlkO54988 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SlkO54988 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SlkO54988 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SlkO54988 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SlkO54988 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SlkO54988 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SlkO54988 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SlkO54988 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SlkO54988 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SlkO54988 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SlkO54988 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SlkO54988 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SlkO54988 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SlkO54988 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SlkO54988 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SlkO54988 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SlkO54988 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SlkO54988 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SlkO54988 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SlkO54988 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SlkO54988 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SlkO54988 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SlkO54988 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SlkO54988 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SlkO54988 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SlkO54988 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SlkO54988 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SlkO54988 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SlkO54988 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SlkO54988 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SlkO54988 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SlkO54988 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SlkO54988 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SlkO54988 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SlkO54988 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SlkO54988 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SlkO54988 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SlkO54988 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SlkO54988 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SlkO54988 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SlkO54988 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SlkO54988 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SlkO54988 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SlkO54988 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms