Protein–RNA interactions for Protein: O35963

Rab33b, Ras-related protein Rab-33B, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33bO35963 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab33bO35963 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms