Protein–RNA interactions for Protein: O35685

Nudc, Nuclear migration protein nudC, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NudcO35685 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NudcO35685 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NudcO35685 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NudcO35685 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
NudcO35685 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NudcO35685 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NudcO35685 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NudcO35685 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NudcO35685 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NudcO35685 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NudcO35685 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NudcO35685 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NudcO35685 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NudcO35685 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NudcO35685 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NudcO35685 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NudcO35685 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NudcO35685 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NudcO35685 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NudcO35685 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NudcO35685 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NudcO35685 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NudcO35685 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NudcO35685 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NudcO35685 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NudcO35685 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NudcO35685 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NudcO35685 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NudcO35685 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NudcO35685 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NudcO35685 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NudcO35685 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NudcO35685 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NudcO35685 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NudcO35685 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NudcO35685 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NudcO35685 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NudcO35685 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NudcO35685 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NudcO35685 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NudcO35685 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NudcO35685 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NudcO35685 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NudcO35685 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NudcO35685 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NudcO35685 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NudcO35685 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NudcO35685 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NudcO35685 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NudcO35685 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NudcO35685 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NudcO35685 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NudcO35685 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NudcO35685 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NudcO35685 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NudcO35685 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NudcO35685 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NudcO35685 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NudcO35685 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NudcO35685 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NudcO35685 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NudcO35685 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NudcO35685 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NudcO35685 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NudcO35685 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NudcO35685 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NudcO35685 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NudcO35685 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NudcO35685 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NudcO35685 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NudcO35685 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NudcO35685 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NudcO35685 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NudcO35685 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NudcO35685 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NudcO35685 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NudcO35685 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NudcO35685 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NudcO35685 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NudcO35685 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NudcO35685 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NudcO35685 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NudcO35685 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NudcO35685 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NudcO35685 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NudcO35685 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NudcO35685 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NudcO35685 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NudcO35685 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NudcO35685 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NudcO35685 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NudcO35685 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NudcO35685 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NudcO35685 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NudcO35685 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NudcO35685 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NudcO35685 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NudcO35685 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NudcO35685 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NudcO35685 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms