Protein–RNA interactions for Protein: O35544

Slc1a6, Excitatory amino acid transporter 4, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a6O35544 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc1a6O35544 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc1a6O35544 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc1a6O35544 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc1a6O35544 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc1a6O35544 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc1a6O35544 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc1a6O35544 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc1a6O35544 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc1a6O35544 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc1a6O35544 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc1a6O35544 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc1a6O35544 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc1a6O35544 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc1a6O35544 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc1a6O35544 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc1a6O35544 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc1a6O35544 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc1a6O35544 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc1a6O35544 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc1a6O35544 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc1a6O35544 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc1a6O35544 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc1a6O35544 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc1a6O35544 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc1a6O35544 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc1a6O35544 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc1a6O35544 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc1a6O35544 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc1a6O35544 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc1a6O35544 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc1a6O35544 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc1a6O35544 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc1a6O35544 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc1a6O35544 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc1a6O35544 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc1a6O35544 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc1a6O35544 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc1a6O35544 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc1a6O35544 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc1a6O35544 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc1a6O35544 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc1a6O35544 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc1a6O35544 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc1a6O35544 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc1a6O35544 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc1a6O35544 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc1a6O35544 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc1a6O35544 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc1a6O35544 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc1a6O35544 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc1a6O35544 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc1a6O35544 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slc1a6O35544 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slc1a6O35544 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slc1a6O35544 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc1a6O35544 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc1a6O35544 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc1a6O35544 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc1a6O35544 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc1a6O35544 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc1a6O35544 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc1a6O35544 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc1a6O35544 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc1a6O35544 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc1a6O35544 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc1a6O35544 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc1a6O35544 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc1a6O35544 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc1a6O35544 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc1a6O35544 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc1a6O35544 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc1a6O35544 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc1a6O35544 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc1a6O35544 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc1a6O35544 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc1a6O35544 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc1a6O35544 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc1a6O35544 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc1a6O35544 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Slc1a6O35544 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc1a6O35544 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc1a6O35544 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc1a6O35544 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc1a6O35544 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc1a6O35544 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc1a6O35544 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc1a6O35544 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc1a6O35544 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Slc1a6O35544 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc1a6O35544 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc1a6O35544 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc1a6O35544 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc1a6O35544 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc1a6O35544 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc1a6O35544 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc1a6O35544 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Slc1a6O35544 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc1a6O35544 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc1a6O35544 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms