Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Ptpn9O35239 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ptpn9O35239 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Ptpn9O35239 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ptpn9O35239 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Ptpn9O35239 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
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Ptpn9O35239 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Ptpn9O35239 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ptpn9O35239 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Ptpn9O35239 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ptpn9O35239 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ptpn9O35239 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ptpn9O35239 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ptpn9O35239 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ptpn9O35239 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ptpn9O35239 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Ptpn9O35239 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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Ptpn9O35239 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ptpn9O35239 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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Ptpn9O35239 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ptpn9O35239 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ptpn9O35239 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Ptpn9O35239 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Ptpn9O35239 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Ptpn9O35239 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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