Protein–RNA interactions for Protein: O08992

Sdcbp, Syntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdcbpO08992 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms