Protein–RNA interactions for Protein: O08784

Tcof1, Treacle protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcof1O08784 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcof1O08784 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcof1O08784 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcof1O08784 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcof1O08784 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcof1O08784 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcof1O08784 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcof1O08784 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcof1O08784 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcof1O08784 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcof1O08784 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcof1O08784 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcof1O08784 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcof1O08784 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcof1O08784 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcof1O08784 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcof1O08784 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcof1O08784 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcof1O08784 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcof1O08784 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcof1O08784 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcof1O08784 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tcof1O08784 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tcof1O08784 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tcof1O08784 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tcof1O08784 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tcof1O08784 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tcof1O08784 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tcof1O08784 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tcof1O08784 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tcof1O08784 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tcof1O08784 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tcof1O08784 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Tcof1O08784 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tcof1O08784 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tcof1O08784 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Tcof1O08784 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tcof1O08784 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tcof1O08784 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tcof1O08784 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tcof1O08784 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tcof1O08784 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tcof1O08784 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tcof1O08784 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tcof1O08784 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tcof1O08784 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Tcof1O08784 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Tcof1O08784 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tcof1O08784 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Tcof1O08784 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Tcof1O08784 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tcof1O08784 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tcof1O08784 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tcof1O08784 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tcof1O08784 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tcof1O08784 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tcof1O08784 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tcof1O08784 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcof1O08784 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcof1O08784 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcof1O08784 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcof1O08784 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcof1O08784 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcof1O08784 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcof1O08784 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcof1O08784 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcof1O08784 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcof1O08784 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcof1O08784 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcof1O08784 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcof1O08784 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcof1O08784 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcof1O08784 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcof1O08784 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcof1O08784 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcof1O08784 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcof1O08784 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tcof1O08784 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tcof1O08784 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tcof1O08784 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tcof1O08784 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Tcof1O08784 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tcof1O08784 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tcof1O08784 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tcof1O08784 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tcof1O08784 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tcof1O08784 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tcof1O08784 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tcof1O08784 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tcof1O08784 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tcof1O08784 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tcof1O08784 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tcof1O08784 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tcof1O08784 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tcof1O08784 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tcof1O08784 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tcof1O08784 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tcof1O08784 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tcof1O08784 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tcof1O08784 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
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