Protein–RNA interactions for Protein: O08709

Prdx6, Peroxiredoxin-6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdx6O08709 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prdx6O08709 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prdx6O08709 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prdx6O08709 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdx6O08709 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms