Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MsmbO08540 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MsmbO08540 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
MsmbO08540 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
MsmbO08540 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MsmbO08540 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
MsmbO08540 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
MsmbO08540 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
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