Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm379J3QQ19 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm379J3QQ19 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm379J3QQ19 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm379J3QQ19 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm379J3QQ19 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm379J3QQ19 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm379J3QQ19 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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Gm379J3QQ19 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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Gm379J3QQ19 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
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Gm379J3QQ19 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
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Gm379J3QQ19 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
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Gm379J3QQ19 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
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Gm379J3QQ19 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
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