Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms