Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smim18J3QNP2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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