Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm3415J3QMS8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm3415J3QMS8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm3415J3QMS8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm3415J3QMS8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm3415J3QMS8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm3415J3QMS8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm3415J3QMS8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm3415J3QMS8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm3415J3QMS8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm3415J3QMS8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm3415J3QMS8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm3415J3QMS8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm3415J3QMS8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm3415J3QMS8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm3415J3QMS8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm3415J3QMS8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm3415J3QMS8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm3415J3QMS8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm3415J3QMS8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm3415J3QMS8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm3415J3QMS8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm3415J3QMS8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm3415J3QMS8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm3415J3QMS8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm3415J3QMS8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm3415J3QMS8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm3415J3QMS8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm3415J3QMS8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm3415J3QMS8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gm3415J3QMS8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gm3415J3QMS8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gm3415J3QMS8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gm3415J3QMS8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3415J3QMS8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3415J3QMS8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3415J3QMS8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3415J3QMS8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3415J3QMS8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3415J3QMS8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3415J3QMS8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3415J3QMS8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3415J3QMS8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3415J3QMS8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3415J3QMS8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3415J3QMS8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3415J3QMS8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3415J3QMS8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3415J3QMS8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3415J3QMS8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3415J3QMS8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3415J3QMS8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3415J3QMS8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm3415J3QMS8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm3415J3QMS8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm3415J3QMS8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm3415J3QMS8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm3415J3QMS8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm3415J3QMS8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm3415J3QMS8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm3415J3QMS8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm3415J3QMS8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm3415J3QMS8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm3415J3QMS8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm3415J3QMS8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm3415J3QMS8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm3415J3QMS8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm3415J3QMS8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm3415J3QMS8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm3415J3QMS8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm3415J3QMS8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm3415J3QMS8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm3415J3QMS8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm3415J3QMS8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm3415J3QMS8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm3415J3QMS8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm3415J3QMS8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm3415J3QMS8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm3415J3QMS8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm3415J3QMS8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm3415J3QMS8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm3415J3QMS8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm3415J3QMS8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm3415J3QMS8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm3415J3QMS8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm3415J3QMS8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm3415J3QMS8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm3415J3QMS8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm3415J3QMS8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm3415J3QMS8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm3415J3QMS8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm3415J3QMS8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm3415J3QMS8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm3415J3QMS8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm3415J3QMS8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm3415J3QMS8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm3415J3QMS8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm3415J3QMS8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm3415J3QMS8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm3415J3QMS8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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