Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

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Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Taf4bG5E8Z2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Taf4bG5E8Z2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Taf4bG5E8Z2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Taf4bG5E8Z2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Taf4bG5E8Z2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Taf4bG5E8Z2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Taf4bG5E8Z2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Taf4bG5E8Z2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Taf4bG5E8Z2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Taf4bG5E8Z2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Taf4bG5E8Z2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Taf4bG5E8Z2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Taf4bG5E8Z2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Taf4bG5E8Z2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Taf4bG5E8Z2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Taf4bG5E8Z2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Taf4bG5E8Z2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Taf4bG5E8Z2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Taf4bG5E8Z2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Taf4bG5E8Z2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Taf4bG5E8Z2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Taf4bG5E8Z2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Taf4bG5E8Z2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Taf4bG5E8Z2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Taf4bG5E8Z2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Taf4bG5E8Z2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Taf4bG5E8Z2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Taf4bG5E8Z2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Taf4bG5E8Z2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Taf4bG5E8Z2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Taf4bG5E8Z2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Taf4bG5E8Z2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Taf4bG5E8Z2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Taf4bG5E8Z2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Taf4bG5E8Z2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Taf4bG5E8Z2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Taf4bG5E8Z2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Taf4bG5E8Z2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Taf4bG5E8Z2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Taf4bG5E8Z2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Taf4bG5E8Z2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Taf4bG5E8Z2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Taf4bG5E8Z2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Taf4bG5E8Z2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Taf4bG5E8Z2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Taf4bG5E8Z2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Taf4bG5E8Z2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Taf4bG5E8Z2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Taf4bG5E8Z2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Taf4bG5E8Z2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Taf4bG5E8Z2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Taf4bG5E8Z2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Taf4bG5E8Z2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Taf4bG5E8Z2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Taf4bG5E8Z2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Taf4bG5E8Z2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Taf4bG5E8Z2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Taf4bG5E8Z2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Taf4bG5E8Z2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Taf4bG5E8Z2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Taf4bG5E8Z2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Taf4bG5E8Z2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Taf4bG5E8Z2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Taf4bG5E8Z2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Taf4bG5E8Z2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Taf4bG5E8Z2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Taf4bG5E8Z2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Taf4bG5E8Z2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Taf4bG5E8Z2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Taf4bG5E8Z2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Taf4bG5E8Z2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Taf4bG5E8Z2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Taf4bG5E8Z2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Taf4bG5E8Z2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Taf4bG5E8Z2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Taf4bG5E8Z2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Taf4bG5E8Z2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Taf4bG5E8Z2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Taf4bG5E8Z2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Taf4bG5E8Z2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Taf4bG5E8Z2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Taf4bG5E8Z2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Taf4bG5E8Z2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Taf4bG5E8Z2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Taf4bG5E8Z2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Taf4bG5E8Z2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Taf4bG5E8Z2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Taf4bG5E8Z2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Taf4bG5E8Z2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Taf4bG5E8Z2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Taf4bG5E8Z2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Taf4bG5E8Z2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Taf4bG5E8Z2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Taf4bG5E8Z2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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