Protein–RNA interactions for Protein: G5E8C1

Vmn1r67, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r67G5E8C1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r67G5E8C1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms