Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf148G3X9R7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf148G3X9R7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf148G3X9R7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf148G3X9R7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf148G3X9R7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms