Protein–RNA interactions for Protein: G3X9M3

Hmgxb3, HMG box domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgxb3G3X9M3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms