Protein–RNA interactions for Protein: F6YKI2

Gm8220, Predicted gene 8220 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8220F6YKI2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8220F6YKI2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm8220F6YKI2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8220F6YKI2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8220F6YKI2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8220F6YKI2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8220F6YKI2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8220F6YKI2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8220F6YKI2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8220F6YKI2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8220F6YKI2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8220F6YKI2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8220F6YKI2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8220F6YKI2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8220F6YKI2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8220F6YKI2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8220F6YKI2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8220F6YKI2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8220F6YKI2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8220F6YKI2 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8220F6YKI2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8220F6YKI2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8220F6YKI2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8220F6YKI2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8220F6YKI2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8220F6YKI2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms