Protein–RNA interactions for Protein: F6YJZ8

Gm6460, Predicted gene 6460, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6460F6YJZ8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm6460F6YJZ8 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm6460F6YJZ8 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm6460F6YJZ8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm6460F6YJZ8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm6460F6YJZ8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm6460F6YJZ8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm6460F6YJZ8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm6460F6YJZ8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm6460F6YJZ8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm6460F6YJZ8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm6460F6YJZ8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm6460F6YJZ8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm6460F6YJZ8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm6460F6YJZ8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6460F6YJZ8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6460F6YJZ8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6460F6YJZ8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6460F6YJZ8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6460F6YJZ8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6460F6YJZ8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6460F6YJZ8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6460F6YJZ8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6460F6YJZ8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6460F6YJZ8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6460F6YJZ8 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6460F6YJZ8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6460F6YJZ8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6460F6YJZ8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6460F6YJZ8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6460F6YJZ8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6460F6YJZ8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6460F6YJZ8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6460F6YJZ8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6460F6YJZ8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6460F6YJZ8 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6460F6YJZ8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6460F6YJZ8 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6460F6YJZ8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm6460F6YJZ8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm6460F6YJZ8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm6460F6YJZ8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm6460F6YJZ8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm6460F6YJZ8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm6460F6YJZ8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm6460F6YJZ8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm6460F6YJZ8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm6460F6YJZ8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm6460F6YJZ8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm6460F6YJZ8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm6460F6YJZ8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm6460F6YJZ8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm6460F6YJZ8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm6460F6YJZ8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6460F6YJZ8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6460F6YJZ8 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6460F6YJZ8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6460F6YJZ8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6460F6YJZ8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6460F6YJZ8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6460F6YJZ8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6460F6YJZ8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6460F6YJZ8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6460F6YJZ8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6460F6YJZ8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6460F6YJZ8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6460F6YJZ8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6460F6YJZ8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6460F6YJZ8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6460F6YJZ8 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6460F6YJZ8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6460F6YJZ8 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6460F6YJZ8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6460F6YJZ8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6460F6YJZ8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6460F6YJZ8 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6460F6YJZ8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6460F6YJZ8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6460F6YJZ8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6460F6YJZ8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6460F6YJZ8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6460F6YJZ8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6460F6YJZ8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6460F6YJZ8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6460F6YJZ8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6460F6YJZ8 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6460F6YJZ8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6460F6YJZ8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6460F6YJZ8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6460F6YJZ8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm6460F6YJZ8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm6460F6YJZ8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm6460F6YJZ8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm6460F6YJZ8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm6460F6YJZ8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm6460F6YJZ8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm6460F6YJZ8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm6460F6YJZ8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm6460F6YJZ8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm6460F6YJZ8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms