Protein–RNA interactions for Protein: F6U3N7

Gm21977, Predicted gene 21977 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21977F6U3N7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21977F6U3N7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21977F6U3N7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21977F6U3N7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21977F6U3N7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21977F6U3N7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21977F6U3N7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21977F6U3N7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21977F6U3N7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21977F6U3N7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21977F6U3N7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21977F6U3N7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21977F6U3N7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21977F6U3N7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21977F6U3N7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21977F6U3N7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21977F6U3N7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21977F6U3N7 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21977F6U3N7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21977F6U3N7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21977F6U3N7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21977F6U3N7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21977F6U3N7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21977F6U3N7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21977F6U3N7 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21977F6U3N7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21977F6U3N7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21977F6U3N7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21977F6U3N7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21977F6U3N7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21977F6U3N7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21977F6U3N7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21977F6U3N7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21977F6U3N7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21977F6U3N7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21977F6U3N7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21977F6U3N7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21977F6U3N7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21977F6U3N7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21977F6U3N7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21977F6U3N7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21977F6U3N7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm21977F6U3N7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm21977F6U3N7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm21977F6U3N7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm21977F6U3N7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm21977F6U3N7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm21977F6U3N7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm21977F6U3N7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21977F6U3N7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21977F6U3N7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21977F6U3N7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21977F6U3N7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21977F6U3N7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21977F6U3N7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21977F6U3N7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21977F6U3N7 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21977F6U3N7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21977F6U3N7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21977F6U3N7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21977F6U3N7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21977F6U3N7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21977F6U3N7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21977F6U3N7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21977F6U3N7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21977F6U3N7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21977F6U3N7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21977F6U3N7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21977F6U3N7 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21977F6U3N7 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21977F6U3N7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21977F6U3N7 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21977F6U3N7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21977F6U3N7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21977F6U3N7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21977F6U3N7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm21977F6U3N7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm21977F6U3N7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21977F6U3N7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21977F6U3N7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21977F6U3N7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21977F6U3N7 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21977F6U3N7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21977F6U3N7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21977F6U3N7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21977F6U3N7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21977F6U3N7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21977F6U3N7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21977F6U3N7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21977F6U3N7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21977F6U3N7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21977F6U3N7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21977F6U3N7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21977F6U3N7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21977F6U3N7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21977F6U3N7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21977F6U3N7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21977F6U3N7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21977F6U3N7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21977F6U3N7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms