Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syngap1F6SEU4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syngap1F6SEU4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syngap1F6SEU4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syngap1F6SEU4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syngap1F6SEU4 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syngap1F6SEU4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syngap1F6SEU4 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syngap1F6SEU4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syngap1F6SEU4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syngap1F6SEU4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syngap1F6SEU4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syngap1F6SEU4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syngap1F6SEU4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syngap1F6SEU4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syngap1F6SEU4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syngap1F6SEU4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syngap1F6SEU4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Syngap1F6SEU4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syngap1F6SEU4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syngap1F6SEU4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Syngap1F6SEU4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Syngap1F6SEU4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Syngap1F6SEU4 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Syngap1F6SEU4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Syngap1F6SEU4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Syngap1F6SEU4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Syngap1F6SEU4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Syngap1F6SEU4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Syngap1F6SEU4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Syngap1F6SEU4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Syngap1F6SEU4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Syngap1F6SEU4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Syngap1F6SEU4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Syngap1F6SEU4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syngap1F6SEU4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syngap1F6SEU4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syngap1F6SEU4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syngap1F6SEU4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syngap1F6SEU4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syngap1F6SEU4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syngap1F6SEU4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syngap1F6SEU4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syngap1F6SEU4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syngap1F6SEU4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syngap1F6SEU4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Syngap1F6SEU4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Syngap1F6SEU4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Syngap1F6SEU4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Syngap1F6SEU4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Syngap1F6SEU4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Syngap1F6SEU4 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Syngap1F6SEU4 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Syngap1F6SEU4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Syngap1F6SEU4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Syngap1F6SEU4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syngap1F6SEU4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syngap1F6SEU4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syngap1F6SEU4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syngap1F6SEU4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syngap1F6SEU4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syngap1F6SEU4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Syngap1F6SEU4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syngap1F6SEU4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syngap1F6SEU4 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syngap1F6SEU4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syngap1F6SEU4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syngap1F6SEU4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syngap1F6SEU4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syngap1F6SEU4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syngap1F6SEU4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syngap1F6SEU4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syngap1F6SEU4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syngap1F6SEU4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syngap1F6SEU4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syngap1F6SEU4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syngap1F6SEU4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syngap1F6SEU4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syngap1F6SEU4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syngap1F6SEU4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syngap1F6SEU4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Syngap1F6SEU4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syngap1F6SEU4 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syngap1F6SEU4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syngap1F6SEU4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syngap1F6SEU4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syngap1F6SEU4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syngap1F6SEU4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Syngap1F6SEU4 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Syngap1F6SEU4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syngap1F6SEU4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syngap1F6SEU4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syngap1F6SEU4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syngap1F6SEU4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syngap1F6SEU4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syngap1F6SEU4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syngap1F6SEU4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syngap1F6SEU4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syngap1F6SEU4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syngap1F6SEU4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms