Protein–RNA interactions for Protein: F6R3P9

Prl3d2, Growth hormone d5, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prl3d2F6R3P9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prl3d2F6R3P9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prl3d2F6R3P9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prl3d2F6R3P9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prl3d2F6R3P9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prl3d2F6R3P9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prl3d2F6R3P9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prl3d2F6R3P9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prl3d2F6R3P9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Prl3d2F6R3P9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prl3d2F6R3P9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prl3d2F6R3P9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prl3d2F6R3P9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prl3d2F6R3P9 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Prl3d2F6R3P9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prl3d2F6R3P9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prl3d2F6R3P9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prl3d2F6R3P9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prl3d2F6R3P9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prl3d2F6R3P9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prl3d2F6R3P9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prl3d2F6R3P9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prl3d2F6R3P9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Prl3d2F6R3P9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prl3d2F6R3P9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prl3d2F6R3P9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prl3d2F6R3P9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prl3d2F6R3P9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prl3d2F6R3P9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prl3d2F6R3P9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prl3d2F6R3P9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prl3d2F6R3P9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prl3d2F6R3P9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prl3d2F6R3P9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prl3d2F6R3P9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prl3d2F6R3P9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prl3d2F6R3P9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Prl3d2F6R3P9 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Prl3d2F6R3P9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prl3d2F6R3P9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Prl3d2F6R3P9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prl3d2F6R3P9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prl3d2F6R3P9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prl3d2F6R3P9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prl3d2F6R3P9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prl3d2F6R3P9 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prl3d2F6R3P9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prl3d2F6R3P9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prl3d2F6R3P9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prl3d2F6R3P9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prl3d2F6R3P9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prl3d2F6R3P9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prl3d2F6R3P9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prl3d2F6R3P9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prl3d2F6R3P9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prl3d2F6R3P9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Prl3d2F6R3P9 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prl3d2F6R3P9 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prl3d2F6R3P9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Prl3d2F6R3P9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prl3d2F6R3P9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prl3d2F6R3P9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prl3d2F6R3P9 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prl3d2F6R3P9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prl3d2F6R3P9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prl3d2F6R3P9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prl3d2F6R3P9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prl3d2F6R3P9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prl3d2F6R3P9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Prl3d2F6R3P9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Prl3d2F6R3P9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prl3d2F6R3P9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prl3d2F6R3P9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prl3d2F6R3P9 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prl3d2F6R3P9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prl3d2F6R3P9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prl3d2F6R3P9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prl3d2F6R3P9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prl3d2F6R3P9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prl3d2F6R3P9 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prl3d2F6R3P9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prl3d2F6R3P9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prl3d2F6R3P9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prl3d2F6R3P9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prl3d2F6R3P9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prl3d2F6R3P9 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Prl3d2F6R3P9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prl3d2F6R3P9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prl3d2F6R3P9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Prl3d2F6R3P9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prl3d2F6R3P9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prl3d2F6R3P9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prl3d2F6R3P9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prl3d2F6R3P9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prl3d2F6R3P9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prl3d2F6R3P9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prl3d2F6R3P9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prl3d2F6R3P9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prl3d2F6R3P9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prl3d2F6R3P9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms