Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6W0

BC030500, cDNA sequence BC030500 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC030500E9Q6W0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BC030500E9Q6W0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms