Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20518E9Q548 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms