Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx60E9PZQ1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx60E9PZQ1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx60E9PZQ1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx60E9PZQ1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx60E9PZQ1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx60E9PZQ1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx60E9PZQ1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx60E9PZQ1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddx60E9PZQ1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddx60E9PZQ1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddx60E9PZQ1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddx60E9PZQ1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddx60E9PZQ1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddx60E9PZQ1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddx60E9PZQ1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx60E9PZQ1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx60E9PZQ1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx60E9PZQ1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx60E9PZQ1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx60E9PZQ1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx60E9PZQ1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx60E9PZQ1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx60E9PZQ1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx60E9PZQ1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx60E9PZQ1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx60E9PZQ1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx60E9PZQ1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx60E9PZQ1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx60E9PZQ1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddx60E9PZQ1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddx60E9PZQ1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddx60E9PZQ1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddx60E9PZQ1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddx60E9PZQ1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddx60E9PZQ1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddx60E9PZQ1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddx60E9PZQ1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddx60E9PZQ1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddx60E9PZQ1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ddx60E9PZQ1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ddx60E9PZQ1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ddx60E9PZQ1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ddx60E9PZQ1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx60E9PZQ1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx60E9PZQ1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx60E9PZQ1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx60E9PZQ1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx60E9PZQ1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx60E9PZQ1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx60E9PZQ1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx60E9PZQ1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx60E9PZQ1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx60E9PZQ1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx60E9PZQ1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx60E9PZQ1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx60E9PZQ1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx60E9PZQ1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx60E9PZQ1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx60E9PZQ1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx60E9PZQ1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx60E9PZQ1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx60E9PZQ1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx60E9PZQ1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx60E9PZQ1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx60E9PZQ1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx60E9PZQ1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx60E9PZQ1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx60E9PZQ1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx60E9PZQ1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx60E9PZQ1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx60E9PZQ1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx60E9PZQ1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx60E9PZQ1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx60E9PZQ1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx60E9PZQ1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx60E9PZQ1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx60E9PZQ1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx60E9PZQ1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx60E9PZQ1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx60E9PZQ1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx60E9PZQ1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx60E9PZQ1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx60E9PZQ1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddx60E9PZQ1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddx60E9PZQ1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddx60E9PZQ1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddx60E9PZQ1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddx60E9PZQ1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddx60E9PZQ1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddx60E9PZQ1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddx60E9PZQ1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddx60E9PZQ1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddx60E9PZQ1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddx60E9PZQ1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddx60E9PZQ1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx60E9PZQ1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx60E9PZQ1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx60E9PZQ1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx60E9PZQ1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
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