Protein–RNA interactions for Protein: E9PWP9

4931408C20Rik, RIKEN cDNA 4931408C20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931408C20RikE9PWP9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4931408C20RikE9PWP9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4931408C20RikE9PWP9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4931408C20RikE9PWP9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
4931408C20RikE9PWP9 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
4931408C20RikE9PWP9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4931408C20RikE9PWP9 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
4931408C20RikE9PWP9 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4931408C20RikE9PWP9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4931408C20RikE9PWP9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4931408C20RikE9PWP9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
4931408C20RikE9PWP9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4931408C20RikE9PWP9 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4931408C20RikE9PWP9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4931408C20RikE9PWP9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4931408C20RikE9PWP9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4931408C20RikE9PWP9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
4931408C20RikE9PWP9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4931408C20RikE9PWP9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4931408C20RikE9PWP9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
4931408C20RikE9PWP9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
4931408C20RikE9PWP9 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
4931408C20RikE9PWP9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
4931408C20RikE9PWP9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4931408C20RikE9PWP9 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4931408C20RikE9PWP9 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4931408C20RikE9PWP9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
4931408C20RikE9PWP9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4931408C20RikE9PWP9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
4931408C20RikE9PWP9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
4931408C20RikE9PWP9 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
4931408C20RikE9PWP9 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
4931408C20RikE9PWP9 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
4931408C20RikE9PWP9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
4931408C20RikE9PWP9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
4931408C20RikE9PWP9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
4931408C20RikE9PWP9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4931408C20RikE9PWP9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4931408C20RikE9PWP9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4931408C20RikE9PWP9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4931408C20RikE9PWP9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4931408C20RikE9PWP9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
4931408C20RikE9PWP9 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
4931408C20RikE9PWP9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4931408C20RikE9PWP9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4931408C20RikE9PWP9 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
4931408C20RikE9PWP9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4931408C20RikE9PWP9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4931408C20RikE9PWP9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4931408C20RikE9PWP9 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
4931408C20RikE9PWP9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4931408C20RikE9PWP9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4931408C20RikE9PWP9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4931408C20RikE9PWP9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4931408C20RikE9PWP9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4931408C20RikE9PWP9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4931408C20RikE9PWP9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
4931408C20RikE9PWP9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4931408C20RikE9PWP9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4931408C20RikE9PWP9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4931408C20RikE9PWP9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4931408C20RikE9PWP9 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
4931408C20RikE9PWP9 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
4931408C20RikE9PWP9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4931408C20RikE9PWP9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4931408C20RikE9PWP9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
4931408C20RikE9PWP9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4931408C20RikE9PWP9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
4931408C20RikE9PWP9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4931408C20RikE9PWP9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
4931408C20RikE9PWP9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
4931408C20RikE9PWP9 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
4931408C20RikE9PWP9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4931408C20RikE9PWP9 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
4931408C20RikE9PWP9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
4931408C20RikE9PWP9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
4931408C20RikE9PWP9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4931408C20RikE9PWP9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
4931408C20RikE9PWP9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
4931408C20RikE9PWP9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4931408C20RikE9PWP9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4931408C20RikE9PWP9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4931408C20RikE9PWP9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4931408C20RikE9PWP9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4931408C20RikE9PWP9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4931408C20RikE9PWP9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
4931408C20RikE9PWP9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4931408C20RikE9PWP9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4931408C20RikE9PWP9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4931408C20RikE9PWP9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4931408C20RikE9PWP9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
4931408C20RikE9PWP9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4931408C20RikE9PWP9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4931408C20RikE9PWP9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4931408C20RikE9PWP9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
4931408C20RikE9PWP9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4931408C20RikE9PWP9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4931408C20RikE9PWP9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
4931408C20RikE9PWP9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
4931408C20RikE9PWP9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms