Protein–RNA interactions for Protein: E9PVW1

Zkscan7, Zinc finger with KRAB and SCAN domains 7, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan7E9PVW1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zkscan7E9PVW1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zkscan7E9PVW1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zkscan7E9PVW1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zkscan7E9PVW1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zkscan7E9PVW1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Zkscan7E9PVW1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Zkscan7E9PVW1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Zkscan7E9PVW1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Zkscan7E9PVW1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zkscan7E9PVW1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zkscan7E9PVW1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zkscan7E9PVW1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zkscan7E9PVW1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zkscan7E9PVW1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zkscan7E9PVW1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Zkscan7E9PVW1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zkscan7E9PVW1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zkscan7E9PVW1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zkscan7E9PVW1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Zkscan7E9PVW1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zkscan7E9PVW1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zkscan7E9PVW1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zkscan7E9PVW1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zkscan7E9PVW1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zkscan7E9PVW1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zkscan7E9PVW1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zkscan7E9PVW1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zkscan7E9PVW1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zkscan7E9PVW1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zkscan7E9PVW1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zkscan7E9PVW1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zkscan7E9PVW1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zkscan7E9PVW1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zkscan7E9PVW1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zkscan7E9PVW1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zkscan7E9PVW1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zkscan7E9PVW1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zkscan7E9PVW1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zkscan7E9PVW1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zkscan7E9PVW1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zkscan7E9PVW1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zkscan7E9PVW1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zkscan7E9PVW1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zkscan7E9PVW1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zkscan7E9PVW1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zkscan7E9PVW1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zkscan7E9PVW1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zkscan7E9PVW1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zkscan7E9PVW1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zkscan7E9PVW1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Zkscan7E9PVW1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Zkscan7E9PVW1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zkscan7E9PVW1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zkscan7E9PVW1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zkscan7E9PVW1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Zkscan7E9PVW1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zkscan7E9PVW1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zkscan7E9PVW1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zkscan7E9PVW1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zkscan7E9PVW1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zkscan7E9PVW1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zkscan7E9PVW1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zkscan7E9PVW1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zkscan7E9PVW1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zkscan7E9PVW1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zkscan7E9PVW1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zkscan7E9PVW1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zkscan7E9PVW1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zkscan7E9PVW1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zkscan7E9PVW1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zkscan7E9PVW1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zkscan7E9PVW1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zkscan7E9PVW1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zkscan7E9PVW1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zkscan7E9PVW1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zkscan7E9PVW1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Zkscan7E9PVW1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zkscan7E9PVW1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zkscan7E9PVW1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zkscan7E9PVW1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zkscan7E9PVW1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zkscan7E9PVW1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zkscan7E9PVW1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zkscan7E9PVW1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zkscan7E9PVW1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Zkscan7E9PVW1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zkscan7E9PVW1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zkscan7E9PVW1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zkscan7E9PVW1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zkscan7E9PVW1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zkscan7E9PVW1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zkscan7E9PVW1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zkscan7E9PVW1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zkscan7E9PVW1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zkscan7E9PVW1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zkscan7E9PVW1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Zkscan7E9PVW1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Zkscan7E9PVW1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zkscan7E9PVW1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms