Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1E9PVA8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gcn1E9PVA8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gcn1E9PVA8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gcn1E9PVA8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gcn1E9PVA8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gcn1E9PVA8 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gcn1E9PVA8 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gcn1E9PVA8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gcn1E9PVA8 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gcn1E9PVA8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gcn1E9PVA8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gcn1E9PVA8 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gcn1E9PVA8 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gcn1E9PVA8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gcn1E9PVA8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gcn1E9PVA8 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gcn1E9PVA8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gcn1E9PVA8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gcn1E9PVA8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gcn1E9PVA8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gcn1E9PVA8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gcn1E9PVA8 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gcn1E9PVA8 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gcn1E9PVA8 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gcn1E9PVA8 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gcn1E9PVA8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gcn1E9PVA8 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gcn1E9PVA8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gcn1E9PVA8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gcn1E9PVA8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gcn1E9PVA8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gcn1E9PVA8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gcn1E9PVA8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gcn1E9PVA8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gcn1E9PVA8 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gcn1E9PVA8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gcn1E9PVA8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gcn1E9PVA8 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gcn1E9PVA8 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gcn1E9PVA8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gcn1E9PVA8 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gcn1E9PVA8 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gcn1E9PVA8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gcn1E9PVA8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gcn1E9PVA8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcn1E9PVA8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcn1E9PVA8 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcn1E9PVA8 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcn1E9PVA8 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcn1E9PVA8 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcn1E9PVA8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcn1E9PVA8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcn1E9PVA8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcn1E9PVA8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcn1E9PVA8 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcn1E9PVA8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcn1E9PVA8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcn1E9PVA8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcn1E9PVA8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gcn1E9PVA8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms