Protein–RNA interactions for Protein: E9PUQ3

AU019823, Expressed sequence AU019823, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU019823E9PUQ3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AU019823E9PUQ3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AU019823E9PUQ3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AU019823E9PUQ3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AU019823E9PUQ3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AU019823E9PUQ3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
AU019823E9PUQ3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AU019823E9PUQ3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AU019823E9PUQ3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AU019823E9PUQ3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AU019823E9PUQ3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AU019823E9PUQ3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AU019823E9PUQ3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AU019823E9PUQ3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AU019823E9PUQ3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AU019823E9PUQ3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AU019823E9PUQ3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
AU019823E9PUQ3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
AU019823E9PUQ3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AU019823E9PUQ3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AU019823E9PUQ3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AU019823E9PUQ3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AU019823E9PUQ3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AU019823E9PUQ3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AU019823E9PUQ3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AU019823E9PUQ3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AU019823E9PUQ3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AU019823E9PUQ3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AU019823E9PUQ3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AU019823E9PUQ3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AU019823E9PUQ3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AU019823E9PUQ3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AU019823E9PUQ3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AU019823E9PUQ3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AU019823E9PUQ3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AU019823E9PUQ3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AU019823E9PUQ3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AU019823E9PUQ3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AU019823E9PUQ3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AU019823E9PUQ3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AU019823E9PUQ3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AU019823E9PUQ3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AU019823E9PUQ3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AU019823E9PUQ3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
AU019823E9PUQ3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AU019823E9PUQ3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AU019823E9PUQ3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AU019823E9PUQ3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AU019823E9PUQ3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AU019823E9PUQ3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AU019823E9PUQ3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AU019823E9PUQ3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AU019823E9PUQ3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AU019823E9PUQ3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AU019823E9PUQ3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AU019823E9PUQ3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AU019823E9PUQ3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AU019823E9PUQ3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AU019823E9PUQ3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AU019823E9PUQ3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AU019823E9PUQ3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AU019823E9PUQ3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AU019823E9PUQ3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AU019823E9PUQ3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AU019823E9PUQ3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AU019823E9PUQ3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AU019823E9PUQ3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AU019823E9PUQ3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AU019823E9PUQ3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AU019823E9PUQ3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AU019823E9PUQ3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AU019823E9PUQ3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
AU019823E9PUQ3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AU019823E9PUQ3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AU019823E9PUQ3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AU019823E9PUQ3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
AU019823E9PUQ3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AU019823E9PUQ3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AU019823E9PUQ3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AU019823E9PUQ3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AU019823E9PUQ3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AU019823E9PUQ3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AU019823E9PUQ3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AU019823E9PUQ3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AU019823E9PUQ3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
AU019823E9PUQ3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AU019823E9PUQ3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AU019823E9PUQ3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AU019823E9PUQ3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AU019823E9PUQ3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
AU019823E9PUQ3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AU019823E9PUQ3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AU019823E9PUQ3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AU019823E9PUQ3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AU019823E9PUQ3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AU019823E9PUQ3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AU019823E9PUQ3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AU019823E9PUQ3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AU019823E9PUQ3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AU019823E9PUQ3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms