Protein–RNA interactions for Protein: D3YW29

Rexo5, RNA exonuclease 5, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo5D3YW29 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rexo5D3YW29 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rexo5D3YW29 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rexo5D3YW29 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rexo5D3YW29 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rexo5D3YW29 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Rexo5D3YW29 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rexo5D3YW29 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rexo5D3YW29 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rexo5D3YW29 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rexo5D3YW29 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rexo5D3YW29 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rexo5D3YW29 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rexo5D3YW29 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rexo5D3YW29 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rexo5D3YW29 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Rexo5D3YW29 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rexo5D3YW29 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rexo5D3YW29 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Rexo5D3YW29 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rexo5D3YW29 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rexo5D3YW29 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rexo5D3YW29 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rexo5D3YW29 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rexo5D3YW29 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rexo5D3YW29 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Rexo5D3YW29 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Rexo5D3YW29 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rexo5D3YW29 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rexo5D3YW29 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rexo5D3YW29 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rexo5D3YW29 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rexo5D3YW29 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Rexo5D3YW29 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rexo5D3YW29 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rexo5D3YW29 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rexo5D3YW29 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rexo5D3YW29 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rexo5D3YW29 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rexo5D3YW29 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rexo5D3YW29 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rexo5D3YW29 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rexo5D3YW29 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Rexo5D3YW29 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rexo5D3YW29 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rexo5D3YW29 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rexo5D3YW29 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rexo5D3YW29 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rexo5D3YW29 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rexo5D3YW29 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rexo5D3YW29 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rexo5D3YW29 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rexo5D3YW29 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rexo5D3YW29 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rexo5D3YW29 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rexo5D3YW29 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rexo5D3YW29 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rexo5D3YW29 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rexo5D3YW29 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rexo5D3YW29 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rexo5D3YW29 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rexo5D3YW29 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rexo5D3YW29 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rexo5D3YW29 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rexo5D3YW29 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rexo5D3YW29 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rexo5D3YW29 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rexo5D3YW29 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rexo5D3YW29 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rexo5D3YW29 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rexo5D3YW29 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rexo5D3YW29 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rexo5D3YW29 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rexo5D3YW29 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rexo5D3YW29 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rexo5D3YW29 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rexo5D3YW29 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rexo5D3YW29 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rexo5D3YW29 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rexo5D3YW29 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rexo5D3YW29 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rexo5D3YW29 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rexo5D3YW29 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Rexo5D3YW29 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Rexo5D3YW29 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rexo5D3YW29 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rexo5D3YW29 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rexo5D3YW29 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rexo5D3YW29 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rexo5D3YW29 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rexo5D3YW29 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rexo5D3YW29 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rexo5D3YW29 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rexo5D3YW29 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rexo5D3YW29 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rexo5D3YW29 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rexo5D3YW29 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rexo5D3YW29 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rexo5D3YW29 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rexo5D3YW29 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
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