Protein–RNA interactions for Protein: D2J0Y4

D7Ertd443e, Centrosomal protein C10orf90 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D7Ertd443eD2J0Y4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
D7Ertd443eD2J0Y4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
D7Ertd443eD2J0Y4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
D7Ertd443eD2J0Y4 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
D7Ertd443eD2J0Y4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
D7Ertd443eD2J0Y4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
D7Ertd443eD2J0Y4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms