Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17333C6EQI3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17333C6EQI3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17333C6EQI3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17333C6EQI3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17333C6EQI3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17333C6EQI3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17333C6EQI3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17333C6EQI3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17333C6EQI3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17333C6EQI3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17333C6EQI3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17333C6EQI3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17333C6EQI3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17333C6EQI3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17333C6EQI3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17333C6EQI3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17333C6EQI3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17333C6EQI3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17333C6EQI3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17333C6EQI3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17333C6EQI3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17333C6EQI3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17333C6EQI3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17333C6EQI3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17333C6EQI3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17333C6EQI3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17333C6EQI3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17333C6EQI3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17333C6EQI3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17333C6EQI3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17333C6EQI3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17333C6EQI3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17333C6EQI3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17333C6EQI3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17333C6EQI3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17333C6EQI3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17333C6EQI3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17333C6EQI3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17333C6EQI3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17333C6EQI3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17333C6EQI3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17333C6EQI3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17333C6EQI3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17333C6EQI3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17333C6EQI3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17333C6EQI3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17333C6EQI3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17333C6EQI3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17333C6EQI3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17333C6EQI3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17333C6EQI3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17333C6EQI3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17333C6EQI3 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17333C6EQI3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17333C6EQI3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17333C6EQI3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17333C6EQI3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17333C6EQI3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17333C6EQI3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17333C6EQI3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17333C6EQI3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17333C6EQI3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17333C6EQI3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17333C6EQI3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17333C6EQI3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17333C6EQI3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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