Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cspp1B2RX88 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cspp1B2RX88 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cspp1B2RX88 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cspp1B2RX88 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cspp1B2RX88 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cspp1B2RX88 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Cspp1B2RX88 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cspp1B2RX88 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cspp1B2RX88 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cspp1B2RX88 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cspp1B2RX88 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cspp1B2RX88 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cspp1B2RX88 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cspp1B2RX88 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Cspp1B2RX88 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cspp1B2RX88 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Cspp1B2RX88 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cspp1B2RX88 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cspp1B2RX88 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cspp1B2RX88 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cspp1B2RX88 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cspp1B2RX88 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cspp1B2RX88 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cspp1B2RX88 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cspp1B2RX88 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cspp1B2RX88 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cspp1B2RX88 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cspp1B2RX88 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cspp1B2RX88 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cspp1B2RX88 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cspp1B2RX88 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms