Protein–RNA interactions for Protein: B2RVB7

Hbb-bh2, Globin b2, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbb-bh2B2RVB7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms