Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zscan5bB2RTN3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zscan5bB2RTN3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zscan5bB2RTN3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zscan5bB2RTN3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Zscan5bB2RTN3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zscan5bB2RTN3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Zscan5bB2RTN3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zscan5bB2RTN3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zscan5bB2RTN3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zscan5bB2RTN3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zscan5bB2RTN3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zscan5bB2RTN3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zscan5bB2RTN3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zscan5bB2RTN3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zscan5bB2RTN3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zscan5bB2RTN3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zscan5bB2RTN3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zscan5bB2RTN3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zscan5bB2RTN3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zscan5bB2RTN3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zscan5bB2RTN3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zscan5bB2RTN3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zscan5bB2RTN3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Zscan5bB2RTN3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zscan5bB2RTN3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zscan5bB2RTN3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zscan5bB2RTN3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zscan5bB2RTN3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zscan5bB2RTN3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zscan5bB2RTN3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zscan5bB2RTN3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zscan5bB2RTN3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zscan5bB2RTN3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zscan5bB2RTN3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zscan5bB2RTN3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zscan5bB2RTN3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zscan5bB2RTN3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zscan5bB2RTN3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zscan5bB2RTN3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zscan5bB2RTN3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zscan5bB2RTN3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zscan5bB2RTN3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zscan5bB2RTN3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zscan5bB2RTN3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zscan5bB2RTN3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Zscan5bB2RTN3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zscan5bB2RTN3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zscan5bB2RTN3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zscan5bB2RTN3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zscan5bB2RTN3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zscan5bB2RTN3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Zscan5bB2RTN3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zscan5bB2RTN3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Zscan5bB2RTN3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zscan5bB2RTN3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zscan5bB2RTN3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zscan5bB2RTN3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zscan5bB2RTN3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Zscan5bB2RTN3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zscan5bB2RTN3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zscan5bB2RTN3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zscan5bB2RTN3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zscan5bB2RTN3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zscan5bB2RTN3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zscan5bB2RTN3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zscan5bB2RTN3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zscan5bB2RTN3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zscan5bB2RTN3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zscan5bB2RTN3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zscan5bB2RTN3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zscan5bB2RTN3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zscan5bB2RTN3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Zscan5bB2RTN3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zscan5bB2RTN3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zscan5bB2RTN3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Zscan5bB2RTN3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zscan5bB2RTN3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zscan5bB2RTN3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zscan5bB2RTN3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zscan5bB2RTN3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zscan5bB2RTN3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zscan5bB2RTN3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zscan5bB2RTN3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Zscan5bB2RTN3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zscan5bB2RTN3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zscan5bB2RTN3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zscan5bB2RTN3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zscan5bB2RTN3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zscan5bB2RTN3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zscan5bB2RTN3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zscan5bB2RTN3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zscan5bB2RTN3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zscan5bB2RTN3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Zscan5bB2RTN3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zscan5bB2RTN3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zscan5bB2RTN3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zscan5bB2RTN3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zscan5bB2RTN3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zscan5bB2RTN3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms