Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms