Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syndig1A2ANU3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syndig1A2ANU3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syndig1A2ANU3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syndig1A2ANU3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syndig1A2ANU3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syndig1A2ANU3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syndig1A2ANU3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syndig1A2ANU3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syndig1A2ANU3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Syndig1A2ANU3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syndig1A2ANU3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Syndig1A2ANU3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syndig1A2ANU3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syndig1A2ANU3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syndig1A2ANU3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syndig1A2ANU3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syndig1A2ANU3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syndig1A2ANU3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syndig1A2ANU3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syndig1A2ANU3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syndig1A2ANU3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syndig1A2ANU3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syndig1A2ANU3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Syndig1A2ANU3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syndig1A2ANU3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syndig1A2ANU3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syndig1A2ANU3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Syndig1A2ANU3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syndig1A2ANU3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syndig1A2ANU3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syndig1A2ANU3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syndig1A2ANU3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syndig1A2ANU3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syndig1A2ANU3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syndig1A2ANU3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Syndig1A2ANU3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syndig1A2ANU3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syndig1A2ANU3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syndig1A2ANU3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syndig1A2ANU3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syndig1A2ANU3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms