Protein–RNA interactions for Protein: A2AFH1

Ube2dnl1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D N-terminal-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2dnl1A2AFH1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2dnl1A2AFH1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms